Что там может быть подключено неправильно? Провода на акустику идут сразу от колодки ГУ через разъемы дверей к динамикам.
Подрулевики управляют громкостью через CAN. Тут подводных камней быть не должно.
Вполне возможно, что проблема с каким-то из динамиков, что приводит, при определенном уровне выходного напряжения, к срабатыванию защиты УМЗЧ, отключающей всю нагрузку.
Для проверки вытащите ГУ. Отключите динамики от колодки (вытянуть пины плюсовых выходов при помощи иголки). Подключайте по одному каналу и проверяйте. На каком звук отрубится - тот и болен.
Манипуляции отключения/подключения производить при выключенном ГУ.